شناسایی و ردیابی اختصاصی phytopthora drechsleri، p. cryptogea و p. erythroseptica با واکنش زنجیره ای پلیمراز

Authors

رضا موستوفی زاده قلمفرسا

نویسنده ضیاء بنی هاشمی

مسئول مکاتبه

abstract

گونه های phytophthora drechsleri، p. cryptogea و p. erythroseptica بیمارگرهای گیاهی اُاُمیستی خویشاوندند و از نظر ریخت شناختی به یک دیگر شباهت دارند. برای تمایز این آرایه ها از یک دیگر و از سایر گونه هایی که صفات ریخت شناختی همگرا دارند، شیوه ای بر اساس واکنش زنجیره ای پلیمراز ساده و تودرتو ابداع شد. بدین منظور مجموعه ای از جدایه ها مربوط به میزبان های مختلف، که نماینده ی تنوع موجود در ژن های هسته ای و میتوکندریایی این گونه ها بودند، بررسی شد. بر اساس توالی فواصل ترانویسی شده ی داخلی (آی تی اِس) و زیرواحد 1 سیتوکروم اکسیداز سی، شش عدد آغازگرِ واکنش زنجیره ای پلیمراز اختصاصی برای p. drechsleriو همچنین بر اساس زیرواحد 1 سیتوکروم اکسیداز سی سه عدد آغازگر اختصاصی برای p. cryptogea و p. erythrosepticaطراحی  و واسنجی شد. واکاوی ها نشان داد که بهترین نامزد برای شناسایی جدایه های p. drechsleriمجموعه ی its-df2 و its-dr2 بود که محصولی 567 جفت بازی را فزون سازی می کرد. استفاده از آغازگرهای cox-cf1 و cox-cr2 بهترین مجموعه برای تمایز p. cryptogea/p. erythroseptica از سایر گونه ها بود و موجب فزون سازی قطعه ای 415 جفت بازی شد. واکاوی نقشه ی آنزیم های برشی این دو گونه نشان داد که جایگاه آنزیم برشی غیرپالیندرومی mnl i در فزونه ی جدایه های p. erythroseptica منحصر به فرد است و از آن می توان برای تمایز این گونه از p. cryptogea استفاده کرد. نتایج این مطالعه نشان داد که استفاده از واکنش زنجیره ای تودرتو برای ردیابی این گونه ها حداقل 100 برابر حساس تر از روش سنتی است.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

شناسایی و ردیابی اختصاصی ‌Phytopthora drechsleri، P. cryptogea و P. erythroseptica با واکنش زنجیره‌ای پلیمراز

گونه‌های Phytophthora drechsleri، P. cryptogea و P. erythroseptica بیمارگرهای گیاهی اُاُمیستی خویشاوندند و از نظر ریخت‌شناختی به یک‌دیگر شباهت دارند. برای تمایز این آرایه‌ها از یک‌دیگر و از سایر گونه‌هایی که صفات ریخت‌شناختی همگرا دارند، شیوه‌ای بر اساس واکنش زنجیره‌ای پلیمراز ساده و تودرتو ابداع شد. بدین منظور مجموعه‌ای از جدایه‌ها مربوط به میزبان‌های مختلف، که نماینده...

full text

ردیابی اختصاصی phytopthora inundata از طریق واکنش زنجیره ای پلیمراز ساده و تودرتو

گونة  phytophthora inundataبه تازگی توصیف شده و به علت خصوصیات ریخت­شناختی و حداکثر دمای رشد غیرعادی، شناسایی آن دشوار است. این گونه با سایر گونه­های بیمارگر گیاهی جنس phytophthoraکه بدون پاپیل و گرماپسند هستند، اشتباه می­شود. در این بررسی برای شناسایی p. inundataشیوه­ای براساس واکنش زنجیره­ای پلیمراز ساده و تودرتو ابداع شد. بدین منظور مجموعه­ای از جدایه­ها مربوط به میزبان­های مختلف که نمایندة ...

full text

ردیابی اختصاصی Phytopthora inundata از طریق واکنش زنجیره‌ای پلیمراز ساده و تودرتو

گونة  Phytophthora inundataبه تازگی توصیف شده و به علت خصوصیات ریخت‌شناختی و حداکثر دمای رشد غیرعادی، شناسایی آن دشوار است. این گونه با سایر گونه‌های بیمارگر گیاهی جنس Phytophthoraکه بدون پاپیل و گرماپسند هستند، اشتباه می‌شود. در این بررسی برای شناسایی P. inundataشیوه‌ای براساس واکنش زنجیره‌ای پلیمراز ساده و تودرتو ابداع شد. بدین منظور مجموعه‌ای از جدایه‌ها مربوط به م...

full text

تنوع ژنتیکی درون‌گونه‌ای Phytophthora cryptogea و P. drechsleri *

گونه‌های Phytophthora drechsleri و P. cryptogea بیمارگرهای گیاهی اُاُمیستی با قرابت فیلوژنتیکی نزدیک هستند. به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی در میان این گونه‌ها، جدایه‌هایی از P. drechsleri و P. cryptogea مربوط به میزبان‌های متفاوت و از مناطق مختلف جهان به همراه جدایه‌هایی از آرایه خویشاوند آنها، P. erythroseptica، از طریق روش  میکروستلایت‌های فزو...

full text

تنوع ژنتیکی درون گونه ای phytophthora cryptogea و p. drechsleri *

گونه­های phytophthora drechsleri و p. cryptogea بیمارگرهای گیاهی اُاُمیستی با قرابت فیلوژنتیکی نزدیک هستند. به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی در میان این گونه­ها، جدایه­هایی از p. drechsleri و p. cryptogea مربوط به میزبان­های متفاوت و از مناطق مختلف جهان به همراه جدایه­هایی از آرایه خویشاوند آنها، p. erythroseptica، از طریق روش  میکروستلایت های فزون­سازی شده تصادفی (rams) مطالعه شدند. این بررسی به کمک...

full text

Phylogenetic history of Phytophthora cryptogea and P. drechsleri isolates from floriculture crops in North Carolina greenhouses.

The evolutionary history of Phytophthora cryptogea and P. drechsleri isolates previously collected from floriculture crops in North Carolina commercial greenhouses was explored with coalescent- and parsimony-based analyses. Initially, 68 isolates representing 13 location-host groups were sequenced at multiple loci. Sequences of all isolates within a group were identical. A subset of isolates we...

full text

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
بیماریهای گیاهی

جلد ۵۱، شماره ۴، صفحات ۵۴۱-۵۵۳

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023